中华民国国防部保密局的前身是国民政府军事委员会调查统计局（简称：军统），1946年6月，军统的公开武装特务部分划归国防部第二厅，秘密核心部分改组为国防部保密局，是中国国民党设立的特务组织。1938 年8月成立。

军统

前身是军事委员会密查组（1927年建）、复兴社特务处（1932年4月建）、军事委员会调查统计局第二处（1937年建）。主要负责人为戴笠。特工人员最多时近5万名，分布到国民革命军、警察、行政机关、交通运输机构，乃至驻外使领馆，专门以监视、绑架、逮捕和暗杀等手段进行活动。军统局在许多地方设有集中营、秘密监狱和看守所，囚禁和迫害共产党人、进步人士和革命学生。

合作

1943年军统和美国海军参谋部情报署合作，共同组成中美特种技术合作所。抗日战争期间，军统也从事一些搜集敌方情报并对敌施行恐怖活动，因此，对打击日本侵略者及汉奸起到了积极的作用。1946年军统局进行改组，其公开特务武装部分与军委会军令部第二厅合并为国防部第二厅，由郑介民任厅长；秘密核心部分组成国防部保密局，毛人凤为局长。1949年，军统主要机构撤至台湾。