平定准噶尔的意义是巨大的，从领土的完整上来看，既避免了领土的分裂，又遏制了外国势力对中国西北地区的入侵。从民族稳定来看，维护了蒙古族的安稳，为蒙古族建立了安宁的发展环境。从国家统一来看，平定准噶尔叛乱维护了国家的统一，避免了内部分裂势力的发展壮大。
首先，准噶尔叛乱是当时部族的领导者噶尔丹发起的，这场战争是在沙俄的鼓励下展开的，沙俄的目的是分裂清朝的领土，彻底的坐拥西北的土地，扩张自己的领土。准噶尔叛乱被平定，避免了这种情况的发生，维护了领土的完整，防止沙俄实力插足中国，煽动更多的部族发动叛乱，这在一定程度上，给予了其它民族一种警告，防止沙俄煽动其它民族发动叛乱。
在准噶尔战争期间，准噶尔部族人们的生活十分困苦，大部分的民众由于战争丧失了自己的家园，不得不颠沛流离。但是在叛乱被平定之后，人们的生活变得安定，更多的人生活重心转向了发展地区经济上，平定准噶尔有利于这个地区的经济发展，更有利于人们生活质量的提高，是非常具有意义的。
这场战争的胜利，维护了国家的统一，遏制了内部分裂势力企图分裂国家的行为，是非常具有历史意义的，使得民族统一于一体，总体上来讲，平定准噶尔的意义主要体现在以上三个方面，其中，最重要的还是维护祖国的统一、领土的完整。
平定准噶尔的评价既有正面的，也有负面的。从正面的来看，这场叛乱的平定，维护了祖国的统一和领土的完整。从负面来看，这场战争中，准噶尔部族民众被清王朝所屠杀，尤其是在战争结束之后，乾隆帝为了避免这个部族再次发生叛乱，将这个部族的许多民众屠杀殆尽，这是非常恶劣的。整体上来讲，这场战争中清王朝的胜利是大势所归，是历史的必然。
首先，这场战争中清王朝是正义的一方，它发起的平定准噶尔叛乱的战争是为了维护祖国的统一，并不是野蛮的侵略，所以受到了子民的支持与维护;而准噶尔部族则是战争的发动者，目的是为了割裂清王朝的领土，帮助沙俄侵略中国领土，这是非正义的，受到了民众的讨伐。
这场战争之所以持续时间久，是清王朝战争的失误造成的。在康熙年间，噶尔丹就被逼自杀身亡，这个部族的叛乱暂时告一段落，然而，清王朝并没有乘胜追击，却选择了就此结束，使得后来的准噶尔部族统治者有机会再次发动战争。在雍正期间，雍正帝在签订了议和条约之后，乾隆帝并没有加强对这里的监控，从而导致了十二年的战争，这是非常严重的失误。
最后，平定准噶尔为这个地区的和平与稳定打下了基础，和平的环境有助于人们生活水平的提高，有利于蒙古族的发展壮大，这些在平定准噶尔的评价中，都是不可缺少的一部分。
在清朝康乾盛世时期，平定准噶尔叛乱成为了主要的任务。康熙、雍正以及乾隆三位皇帝的作战思路不同，平定准噶尔方略也是不尽相同的，但是，整体上来讲，都是以强硬的兵力镇压作为主要的作战策略，期间针对准噶尔部族愿意归顺的子民，清王朝采取的是和平的策略。所以这场战争是刚柔并济的。
在康熙时期，准噶尔叛乱刚刚开始的时候，康熙为了能够迅速的结束这场战争，采用了武力镇压的方式平定叛乱，并且为了能够鼓舞士兵，亲自作战指挥，最终噶尔丹在康熙的武力镇压下服毒自尽。直到策妄阿布坦被赶出西藏，康熙年间的战争基本告一段落。
在雍正时期，噶尔丹策零是当时政权主要的镇压对象，大大小小的战争不断，这其中最出名的是光显寺之战，在这场战役中，准噶尔部的统治者在武力镇压下，向清王朝称臣，雍正秉着和平的理念，采取议和的策略，接纳了他的归顺，维护了祖国的统一。
但是，在乾隆年间，准噶尔部发生内讧，部分贵族选择归顺，但是也有部分贵族再次被怂恿发动叛乱，乾隆皇帝这次采取的政策是铁血的武力镇压，不再采取议和的方式去解决这次叛乱，甚至将沙俄藏起来的阿睦尔撒纳的尸体都坚持要回来。总体来说，平定准噶尔方略中，三个皇帝各不相同，康熙与乾隆态度比较强硬，而雍正相对比较柔和。
