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Nat.Commun.|毒素-解毒剂CRISPR基因驱动系统...

基因驱动通过遗传工程在少数个体中创造出理想的基因突变,然后通过交配可以在不到10代将这个突变传播到整个种群。

理论上,这种机制可以用来防止携带疟疾蚊子传播疾病,或者可能通过破坏入侵物种的繁殖能力来消灭它。 

虽然科学家们已经在实验室里成功地证明了这一概念,但他们发现野生种群总是适应并产生对此产生抵抗力。 当基因驱动发挥作用时,它们要么全部或没有---- 没有细微差别---- 它们传播到所有个体,这可能是一个缺点。

康奈尔大学的一项研究,“A Toxin-Antidote CRISPR Gene Drive System for Regional Population Modification”发表在2月27日的《Nature Communications》杂志上,描述了一种新型的基因驱动,有可能延缓抵抗力。这种方法也可以应用于区域群体,限制其扩散到其他群体产生不良影响。

这篇论文的第一作者,计算生物学的助理教授 Philipp Messer 说: “这是我们开发新的基因驱动在一定程度上解决的两个问题。

在一种被称为归巢驱动的经典基因驱动中,一个后代从母亲那里继承一组基因(或者说基因组),从父亲那里继承另一组基因。 如果一个后代继承的来自父母的基因组只有一方有驱动基因,而另一方没有驱动基因驱动就会自我复制到没有驱动的父母一方的基因组中。

Messer说: “现在这个个体的两个基因组都具有这种驱动力,它将把这种驱动力传递给每一个后代。”。 

新的驱动是使用 CRISPR-Cas9基因编辑技术设计的,因此当驱动自我复制到一个新的基因组中时,CRISPR在没有驱动器的情况将染色体切开,并粘贴新的遗传密码。 但有时候,细胞会修复切口,并随机删除 DNA 字母。 当这种情况发生时,CRISPR 基因驱动不能找到它识别的基因序列来进行切割,从而产生抗性并阻止基因驱动扩散。

自然的遗传变异导致的DNA 序列变化也能产生抗药性,因为 CRISPR 基因驱动必须识别短的基因序列才能进行切割。

Messer说: “我们是第一批证明这是一个重大问题的实验室之一。”。

这篇论文描述了一种新的基因驱动,称为 TARE (Toxin-Antidote Recessive Embryo) ,它通过靶向一个对生物机能至关重要的基因来工作。 与此同时,有机体只需要这种基因的一个完整拷贝就可以存活。 与归巢驱动器所做的剪切和粘贴 DNA 不同,TARE驱动器只是简单地剪切另一个亲本的基因,使其失去功能。

同时,经过改造的 TARE 驱动基因的 DNA 序列已经被重新编码,这个基因可以工作,但不会被后代识别或删除。 如果一个后代继承了两个缺陷基因,这些个体将无法存活,从而从种群中消除这些基因拷贝。 与此同时,随着可存活个体的交配,越来越多存活的后代将携带 TARE 驱动基因

仅仅几个有归巢驱动力的个体就可以在整个种群中传播一种性状。 另一方面,TARE驱动不会将驱动复制粘贴到目标基因中,而是破坏后代中的一个目标基因拷贝。正因为如此,驱动需要更高频率的基因工程个体在种群中传播。 由于这个原因,TARE不太可能从一个不同的种群转移到另一个种群。

在实验室实验中,当携带TARE基因驱动的果蝇被放入野生型果蝇笼中时,仅经过六代笼中所有果蝇都携带TARE驱动

研究人员指出,在野外,抵抗力的确可以随着TARE驱动变化而进化,特别是在非常大的种群中,但他们相信抵抗力的进化时间会更长,而且进化的速度会低得多。

文献来源:

Jackson Champer et al. A toxin-antidote CRISPR gene drive system for regional population modification, Nature Communications (2020). DOI: 10.1038/s41467-020-14960-3

新闻报道:

https://www.eurekalert.org/pub_releases/2020-03/cu-icg030320.php

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