车库纠纷的主管部门需要根据案件的详细情况分析，车库纠纷的类型主要包括以下几种：
该类纠纷应该是数量最多的纠纷，产生纠纷的原因非常复杂，如最常见的开发商在未满足小区业主需求的情况下，高价将车位出售、出租给第三方导致的纠纷;又如开发商将本属于小区共有道路或其他场所改成车位，却又向业主收取停车费导致的纠纷，再如开发商为业主购买停车位，享受停车服务设置各种人为障碍所导致的纠纷等
(二)关于优先满足业主的需要产生的纠纷
法律规定，小区内规划用于停车的车位、车库，应当首先满足业主的需要。“应当”在法律上同“必须”的效力基本一致，只是后者更有强调的意味。“应当首先满足业主需要”，对开发商有强制性，意味着即便开发商拥有对车库的所有权，但只要小区内业主对车库的需要还没有满足，开发商就不能将车库卖给他人。即使已经出售，与第三人签订的合同亦属无效合同。因此，只要业主不明示放弃，开发商就无权将车位、车库卖给外来者，因此，如果开发商在未满足小区内业主停车需要的情况下将小区内车位卖给业主外的人，业主可以基于该项规定提起诉讼，该纠纷也应该适用为车位、车库纠纷这一案由。
在建筑区划内，停车位、车库的所有权应当只限在开发商与住户之间约定所有，并只可在小区住户之间进行转让，而不宜转让给区分所有权人以外的第三人。这样可以有效避免小区由于外来人口过多而导致的人员流动大，不安定因素增多等问题。如果该小区内业主将车位卖给非小区的住户，则小区业主或业委会可以提起诉讼。
(一)当事人的陈述;
(二)书证;
(三)物证;
(四)视听资料;
(五)电子数据;
(六)证人证言;
(七)鉴定意见;
(八)勘验笔录。
综上所述，车库纠纷的主管部门是要根据造成纠纷的具体原因确定的，比如开发商所修建的车库涉嫌侵犯业主合法权益，主管部门是当地的房屋行政主管部门，业主跟物业公司之间因为车库问题引发的纠纷，可以在业主委员会的调解下处理。
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