公积金贷款大额还款违约金应当是根据双方当事人的约定来计算。自借款人的住房公积金贷款放款之日起满一年，即可申请办理提前还款，借款人归还部分的住房公积金贷款的本息，每次还款数额应该不低于6个月的住房公积金贷款的本息额。提前还款所需证件：借款人带上身份证原件及复印件、具备贷款账号的证的资料(包括:借款合同、对账单、还款计划单等更多带有贷款账号的证明材料)以及所需的还款卡，至有关柜台即可办理部分提前还款的手续。
目前商业银行针对提前还款的违约金一般是分两种形式收取，一是按照提前还款时的未结余额的百分比计算，二是若干个月份的利息。
一般来说，提前还款违约金可以通过合同约定的违约金比例计算出来。但不同机构对违约金的征收标准不尽相同，有的规定为5%，有的规定为3%，而有些机构则更低，仅有1%。例如招行就有这样的规定：房贷不满一年提前还款的，收取不低于实际还款额3个月的利息。
如果明确了违约金的收费标准，那么计算方法就很简单了。举例而言，如果合同中注明违约金按照剩余金额的5%支付，当前有1万元未还款额的话，那么需缴纳违约金则为10000乘以5%，得出的计算结果也就是500元。依照此计算方式，需要预先准备多少违约金，相信多数还款人已经心中有数了。当然，提前还款并非想还就能还，除了要支付违约金之外，通常贷款机构会设定一些附加条件。
二、什么样才算提前还款
其实，原因很简单：银行想要设法制止借款人在此期限提前还贷，从而尽可能多地收取利息。一旦想提前还款，让银行挣不够钱，自然会想要用另一种方式迂回的赚回来，即违约金。
在这里，我们首先要知道银行是怎样定义提前还款的。
通常，为了限制提前还款，各贷款机构会对实质性还款行为作出一定的的限制，虽然机构间有所区别，但一般是指在12个月内，借款人提前还款金额超过了本金余额的20%。这时，该用户就会被银行机构定义为“提前还款用户”
借款人提前还贷，直接导致银行的利息收入减少，在银行目前投资渠道欠缺、主要依靠存贷利差获取利润的情况下，提前还贷打乱了银行资金的使用计划。随着提前还贷个案的日趋增多，银行为此所支付的人力物力也因此增加，因而银行要收取一定的费用，以适当补偿损失。
在我们现实生活当中现在如果利用公积金贷款的话，完全是符合法律当中的规定的，并且是需要约定一下具体的还款的期限，如果存在违约情况的话，需要按照双方当事人所签订的合同来支付违约金。这是属于我们国家《民法典》当中所作出的一种明确的规定。
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