1、软件著作权在软件创作完成后即可获得，就是常说的进行软著登记，以起到类似公证的作用。
软件专利则不同。其一，专利必须向专利局提出申请才能获得。其二，软件专利申请描述的是软件的构思。
从上面就可以看出，著作权可以使你在别人对你的软件盗版时，采取保护措施，防止别人盗版。然而对于你的竞争对手来讲，他们跟你一样也是软件开发者，他们可以研究你的软件，理解你的思路，按照你的思路完全可以编出相同效果的软件，而且也不会侵犯你的著作权。这个时候，你软件中最核心的东西，即软件的构思，著作权是无法保护到的。
而软件专利则不同，其是以技术方案的形式申请的，就是你软件流程图的内容。授权后，保护的是软件的构思，他人采用该构思，就可能构成侵权。因此软件专利的保护力度比软件著作权要大的多，能保护软件最核心的东西。
2、二者所采用的法律依据也不一样。
软件的著作权保护依据是《著作权法》和《计算机软件保护条例》，软件的专利权保护依据是《专利法》。
当然了，不是说软件专利保护力度大，就采取软件专利保护，其也有其自身的缺点。
申请专利，专利的技术资料就需要公开，专利权的维持也需每年缴纳年费，专利申请审查周期是2-3年，而软件市场的周期较短。
1、作为税收减免的重要依据
财政部、国家税务总局《关于贯彻落实〈中共中央、国务院关于加强技术创新，发展高科技，实现产业化的决定〉有关税收问题的通知》规定：“对经过国家版权局注册登记，在销售时一并转让著作权、所有权的计算机软件征收营业税，不征收增值税。”
2、作为法律重点保护的依据
《国务院关于印发鼓励软件产业和集成电路产业发展若干政策的通知》第三十二条规定：“国务院著作权行政管理部门要规范和加强软件著作权登记制度，鼓励软件著作权登记，并依据国家法律对已经登记的软件予以重点保护。”比如：软件版权受到侵权时，对于软件著作权登记证书司法机关可不必经过审查，直接作为有力证据使用;此外也是国家著作权管理机关惩处侵犯软件版权行为的执法依据。
3、作为技术出资入股
《关于以高新技术成果出资入股若干问题的规定》规定：“计算机软件可以作为高新技术出资入股，而且作价的比例可以突破公司法20%的限制达到35%”。甚至有的地方政府规定：“可以100%的软件技术作为出资入股”，但是都要求首先必须取得软件著作权登记。
4、作为申请科技成果的依据
科学技术部关于印发《科技成果登记办法》的通知第八条规定：“办理科技成果登记应当提交《科技成果登记表》及下列材料：(一)应用技术成果：相关的评价证明(鉴定证书或者鉴定报告、科技计划项目验收报告、行业准入证明、新产品证书等)和研制报告;或者知识产权证明(专利证书、植物品种权证书、软件登记证书等)和用户证明”。这里的软件登记证书指的是软件著作权的登记证书和软件产品登记证书，其他部委也有类似规定。
5、企业破产后的有形收益
在法律上著作权视为“无形资产”，企业的无形资产不随企业的破产而消失，在企业破产后，无形资产(著作权)的生命力和价值仍然存在，该无形资产(著作权)可以在转让和拍卖中获得有形资金。根据计算机软件著作权登记办法规定：软件著作权登记的时间为受理之日起30个工作日软件注册权证书样本:2009年7月1日 已经实行新版本的软件著作权登记证书，证书从整体的黄色变为蓝色，证书边框也添加了花边，显得更高贵、更大气;唯一的遗憾是证书没有封皮，所有取得证书的软件企业登记用户，只能自己寻找封皮。
在我国软件著作权买的不一样的，一般购买的只是其使用权居多，跟我们通常意义上说的软件专利的区别还是很大。国家一直非常重视软件著作权的公证和登记，主要是其意义十分重大，它可以作为税收减免的重要依据之一，也是法律重点保护的依据，还可以作为技术出资入股。
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