二维聚丙烯酰胺凝胶电泳技术结合了等电聚焦技术(根据蛋白质等电点进行分离)以及SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳技术(根据蛋白质的大小进行分离)。这两项技术结合形成的二维电泳是分离分析“蛋白质”最有效的一种电泳手段。

组成：第一向：等电聚焦电泳（IEF），第二向：SDS-聚丙烯酰氨凝胶电泳（SDS-PAGE）

原理：第一向使等电点不同的蛋白质得到分离，第二向使分子量不同的蛋白得到分离，两向结合得到高分辨率的蛋白图谱。

应用：①用于原核生物和真核生物总蛋白的分离。

②用于发现未知蛋白。