一、苗床消毒
芸豆育苗前，首先将育苗床土进行消毒处理。方法是用50%多菌灵和50%福美霜，按每平方米用药各10克，拌细土10克，均匀撒于畦表，然后用耙耧，使药土与表土混合。
二、定植前穴施
直播地块或育苗定植前进行穴施土壤处理。采用的药剂是50%多菌灵和50%福美霜，按每500穴各用药500克，拌细土10倍，播种或定植前撒于穴内。
三、灌根
在芸豆生长期间，发现有沤根病株，此时不要浇水，要先培土，然后用500倍的65%炭疽福美加上2000倍的强力壮根剂配成的药液灌根，每株灌药液150克~250克，一周一次，连续灌根2次~3次，病株就可恢复生长。
