科学是隐含假设织成的网
科学推理是假说、假设的集合体，检验一个假说就是要检验这样一个集合。科学史一再表明，挖掘出隐藏的假设，科学得以研究它、推翻它，从而科学不断前进，达到革命性的进步。从科学史上的实例，可以看出挖掘出隐含假设的重要性。
古希腊哲学家阿那克西美尼和恩培多克勒认为地球是平坦的，此观点与常识接近，一直持续到中世纪和文艺复兴时期。15世纪航海家哥伦布认为地球是圆的。其论证是看到一艘船驶离海岸时，船体甲板由低到高逐渐消失，然后剩下桅杆，最后消失在视野中，所以证明了我们看到的船体由地球曲面的一侧驶向另一侧。哥白尼也用类似的论证来证明地球是球形的。对相信地球是球体的人来说，船体逐渐消失的现象相当于一个决定性的试验，判定地球是平坦的假说为假，判定地球是球体的假说为真，因为这个现象只能从地球是球体的假说中推导出来。如果地球是平坦的，没有理由相信船体的一部分会比另一部分先消失。
但是事情不是这样简单的。人们完全有办法既接受这个观察事实，又坚持地平说是正确的。因为观察的预言并不是从假说地平或地圆单独推理出来的，而是从它们加上额外的隐含辅助假设“光线以直线传播”一起推出来的。这个辅助假设对推理起关键作用。地平说的推理是：
地球是平坦的。
光线以直线传播。
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所以，船体的底层不会先于桅杆消失。
船体逐渐消失的事实应该否定了地平说，预测检验说明它的前提有错。但前提有两个，是都错了，还是其中的某一个错了？如果是某一个错了，是哪一个？逻辑只能表示这些前提有错，但不能说到底哪一个有错。虽然现在我们知道是第一个前提地平的假说错了，但如果我们愿意想象是第二前提错了，也即是光线不是直线传播而是弯曲传播，则地平的假说完全可以保持。问题是光线弯曲传播加上地平说，可以推导出船体的底层先于桅杆消失的预言吗？应该是可以的。
一个比较抽象、普遍的假说不可能单独推导出观察预言，它必然是假说和相关辅助假设的集体努力的成果。科学是信念、假说和辅助假设结成的网，假说不能单独被检验，被检验的是整个网。当检验产生否定的结果，说明网至少一个“结”有错误，但不能由逻辑而推导出哪一个有错。光线以直线传播的观念是哥伦布和哥白尼地圆说的假说，但它却是一直深藏不露，人们没有意识到这样的假设，更谈不上去检验它们的真假。历史一再表明，因为挖掘出隐藏的假设，科学得以研究它、推翻它，从而达到革命性的进步。
