从石斛种子萌发到壮苗生根形成可以移栽的幼苗，大概需要6～8个月左右，苗长到6～9cm长，根系较发达之后，就可以进行移栽了，移栽前还要经过炼苗阶段，因为组培室的环境是人为控制的，温度、湿度、光照、供其生长的培养基成分都是设定好了的，如果直接移栽，由于生长环境突然的改变，会导致其不能适应外界环境，造成生长缓慢、成活率不高等后果，这就要求，在移栽前要进行炼苗，待其适应了外界的环境再进行移栽。
将石斛组培瓶苗放在温室大棚内，自然光条件下一周左右，待苗的颜色转为翠绿色后，即可移栽，移栽时先将练好的石斛种苗取出，用清水洗去根部的培养基，洗净为止，动作要轻，避免损伤其根和叶。洗净的组培苗可以移栽到简易大棚里的栽培基质中，但为了保证移栽的成活率和生长速度，也可以先移栽在温室大棚穴盆中继续炼苗3～5个月。
