运动是肠道微生物组成的一种可能调节剂，因为一些研究表明，运动与生物多样性的增加和具有有益代谢功能的分类群的代表性有关。相反，训练到筋疲力尽可能与肠道微生物群的失调有关，促进炎症和负面代谢后果。肠道微生物群反过来会影响包括骨骼肌在内的几个远处器官的病理生理学。事实上，肠-肌肉轴可能调节肌肉蛋白质沉积和肌肉功能。在老年人中，该轴可能通过多种机制参与肌肉消耗性疾病的发病机制，包括从饮食营养素中转导促合成代谢刺激物、调节炎症和胰岛素敏感性。免疫系统在这些过程中起着基础性作用，受微生物组分的影响，同时也有助于形成微生物群落。Ticinesi等人在综述文章“运动和免疫系统作为肠道微生物组的调节剂：对肠肌轴假说的影响”中总结了这一领域的最新文献，理清了运动、微生物组、免疫系统和骨骼肌功能之间的复杂关系，并提出了一个解释框架，需要在未来的研究中加以验证。
