人类微生物群具有广泛的功能，有助于代谢过程和免疫系统的活动。肠道微生物群和粘膜完整性受饮食、环境和其他生活方式因素（包括体力活动）的影响。
许多耐力运动员服用益生菌来减轻与运动或免疫抑制有关的胃肠道症状。运动改变的微生物群潜在的变化可能包括微生物群组成、细菌代谢物以及粘膜和免疫标记物。心肺适能与肠道健康的重要指标之间的循证信息对于预防和治疗肠道或免疫疾病具有重要意义。
蒙大拿州立大学博兹曼分校卫生与人类发展系的研究人员在综述文章“益生菌与运动员肠道健康”对运动员肠道健康面临的挑战进行重点分析，并检查最近的研究，旨在确定益生菌对预防运动员胃肠道（GI）症状和屏障功能丧失的影响。最近的研究发现：训练或比赛期间胃肠道症状的发生率和严重程度在证明疗效的研究中降低了约三分之一。添加益生菌后，单菌种乳酸菌、多菌种乳酸菌和双歧杆菌益生菌的胃肠道症状均得到改善，而肠道屏障功能的改善仅针对多菌种益生菌。疗效的可能性随着补充时间的延长而增加。对于减少胃肠道症状的频率和严重程度，以及改善或保持运动训练和比赛期间的肠道屏障功能，最有效的方法似乎是补充至少11周的多菌种乳酸菌和双歧杆菌益生菌鸡尾酒。
