(一)国务院《诉讼费用缴纳办法》规定谁主张谁负担的原则，决定由举证方支付的鉴定费用，仅仅指在诉讼过程中由举证方先垫付，如果最后确定责任在于哪方则人民法院在案件审结后在裁判书中确定由哪方最后支付。
(二)受害人的司法鉴定行为是为了维护自身的合法利益，明确权利和责任，使诉讼顺利进行，其鉴定结果也与被告的违法行为有因果关系。当事人进行的是有根据、有必要的鉴定，由此支付的相关费用理应由加害人承担。
(三)败诉方承担诉讼费用是诉讼费用承担的一般原则。是对败诉方消耗司法资源的一种制裁，基于司法资源与诉讼费用相一致的原理，诉讼费用由败诉方承体现了法律的公平、公正。可以防止民事主体滥诉，减少和防止司法资源无味的浪费，维护国家主权和其经济利益。
综上所述，交通事故司法鉴定费用是为了完成自己的举证责任，但是这种责任是由于被告的不法行为引起的，受害人的伤残是与加害人的行为有直接的因果关系，那么交通事故司法鉴定费用应该由被告承担。
1、鉴定机构应当在与委托人签订司法鉴定协议书之日起三十个工作日内完成委托事项的鉴定。但是，在实际的鉴定实践中，往往比这个规定的时间要长，有的到四十五天，或者两个月。因此，以鉴定会完成后，实际通知的时间为准。
2、如果委托鉴定的内容，涉及复杂、疑难、特殊的技术问题或者检验过程需要较长时间的，经鉴定机构负责人批准，完成鉴定的时间可以延长，延长时间一般不得超过三十个工作日。也就是说两个月应当是延长过的鉴定期限了。如果鉴定机构还要把时间后拖的，如果没有其他特殊情况，应当属于超时鉴定的违规行为。患者及其家属应当积极督促鉴定机构出具鉴定结论。
3、如果司法鉴定机构与委托人，对完成鉴定的时间另有约定的，按照其约定的时间，出具鉴定报告。
4、在鉴定过程中补充或者重新提取鉴定材料所需的时间，是不计入到鉴定时限的。如果是由于当事人的原因没有按时、充分的提供鉴定材料的，造成鉴定时间的延误的，应当由延误的一方承担法律责任。
综合上面所说的，司法鉴定的费用是需要在申请时就要支付，但对于这笔费用都是会由谁提出申请谁来进行申请，只有按规定支付了鉴定费用，那么才可以获得受理，所以，在处理的时候就可以多咨询一下，这样才能保障到当事人的合法权益。
延伸阅读：
