并购外资国家商务部备案申请驳回可以申请行政复议。申请行政复议的时候应该根据《行政复议法》中的规定向有权的行政复议机关申请，当然如果不申请行政复议之间申请行政诉讼的话也是可以的，具体看案件的情况，不同的案件可以采取不同的方式，行政复议机关的确定可以根据法律的规定。
二、行政复议不予受理的情形有哪些?
1.国家的行政安全机关，依照《刑法》中的规定而作出的，明确经过法律授权的行为。
在这种情况之下，是为了审问犯罪嫌疑人而来调查刑事案件，取得证据等等，这个时候对于证人的检查，搜查以及对于银行账户和相关个人信息的收集，都是属于法律明确赋予的权利，所以在这个时候，就算个人隐私被侵犯，或者是个人的权利受到了一点点折损的话，是不可以提出行政复议，就算提出了的话，上级行政部门也没有办法受理这个复议。
由于在我国行政复议的机会只有一次，对于同一件事情，如果已经被驳回一次行政复议的话，那么就说明他是属于类似于上文当中所提到的，不可以接受行政复议的情况，那么此时就没有必要再次提出行政复议了，因为上级部门同样是不会受理的。
三、提请行政复议的条件有什么?
2、申请人与具体行政行为有利害关系;
3、有具体的行政复议请求和理由;
4、法定申请期限内提出;
7、其他行政复议机关尚未受理同一行政复议申请，人民法院尚未受理同一主体就同一事实提起的行政诉讼。
如果按照相关的规定和要求向行政部门或者机构提供了资料办理并购外资国家商务部备案的，但是被驳回了请求的可以就处罚决定提起行政复议，并且需要按照规定准备相应的证据材料来促使最终能够顺利的办理相关的备案的手续。
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