诉讼时效的起算问题，应以合同约定的履行期限届满之次日开始计算，履行期限没有约定或约定不明确的，从确定的履行期限届满之次日开始计算。
因此，合同纠纷的诉讼时效仍应遵循此规定，从知道或者应当知道权利被侵害时起计算。合同是否有效由人民法院通过判决或仲裁机构通过裁决确认，一方在起诉时合同效力并不确定，一方或双方也无权自行确定。因此当事人只能按照合同约定的期限主张权利，时效期间应从约定的履行期限届满之次日起计算。如企业之间的借款合同虽然无效，但时效的起算只能以约定的还款期限届满之次日为准，不能以银行款项借出之次日开始计算，也不能以出借人主张权利被借款人拒绝之次日开始计算，更不能以法院或仲裁机构确认合同无效之次日开始计算。
实践中不乏当事人在合同被确认无效之前不知道合同无效，因此仍期待合同履行而没有及时提出返还或赔偿的请求，此时权利人不知也不应当知道权利受到损害，时效期间不应开始计算。
《民法典》第一百八十八条 向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。
诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。
第一百八十九条 【分期履行债务的诉讼时效】当事人约定同一债务分期履行的，诉讼时效期间自最后一期履行期限届满之日起计算。
第一百九十条 【对法定代理人请求权的诉讼时效】无民事行为能力人或者限制民事行为能力人对其法定代理人的请求权的诉讼时效期间，自该法定代理终止之日起计算。
合同约定的履行期限是计算合同的诉讼时效的重要环节，按照实际的情况进行诉讼时效的计算，确认合同效力纠纷的诉讼时效一般情况下是三年的时间，如果有特殊的规定的，有其他的诉讼时效。
延伸阅读：
设立担保物权，应当依照本法和其他法律的规...
法院是否主动审查合同效力
只有合同纠纷是已经起诉到法院了的，法院在...
附条件合同效力怎样进行规定的
附条件合生效条件又被称为延缓条件，是指合...
劳务分包合法吗?劳务分包合同效...
劳务分包合同有效。第7条规定：“具有劳务...
非法转租合同效力如何认定
出租人与承租人之间的关系。承租人转租为严...
违法建筑买卖合同效力如何
违章建筑区分情况确认效力。建造者不具有土...
