依据我国《民事诉讼法》的规定，被告人由于正当理由不能出庭的，人民法院要依据不能出庭的原因作出处理，如果是中止诉讼情形的，法院会中止诉讼，如果其他情形的，可以委托代理人出庭审理案件。
相关法律规定：
根据《中华人民共和国民事诉讼法》
第六十二条 离婚案件有诉讼代理人的，本人除不能表达意思的以外，仍应出庭;确因特殊情况无法出庭的，必须向人民法院提交书面意见。
第一百五十条 有下列情形之一的，中止诉讼：
(一)一方当事人死亡，需要等待继承人表明是否参加诉讼的;
(二)一方当事人丧失诉讼行为能力，尚未确定法定代理人的;
(三)作为一方当事人的法人或者其他组织终止，尚未确定权利义务承受人的;
(四)一方当事人因不可抗拒的事由，不能参加诉讼的;
(五)本案必须以另一案的审理结果为依据，而另一案尚未审结的;
(六)其他应当中止诉讼的情形。
中止诉讼的原因消除后，恢复诉讼。
1、被告不出庭可以进行缺席判决，由被告自行承担没有辩护的恶果；
2、如必须被告出庭的案件，两次合法传唤不到庭，会采取拘传措施；
3、判决后被告不还，向法院申请强制执行；
4、执行期限一般六个月内，案情复杂经批准可以延长，如果被执行人无财产可供执行，案件只有终结。
相关法律依据：
根据《民事诉讼法》第一百四十四条，被告经传票传唤，无正当理由拒不到庭的，或者未经法庭许可中途退庭的，可以缺席判决。
综上所述，民事纠纷案件被告不能出庭，需要向人民法院提交书面意见，委托代理人或者申请中止诉讼，如果选择缺席判决与对席判决具有同等法律效力，法院同样应当依照法定方式和程序，向缺席的一方当事人宣告判决及送达判决书，并保障当事人的上诉权利的充分行使。
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