宝宝脑部发育不良的原因之孕期有害因素
在母孕期的有害因素，如妊娠患风疹病毒、巨神经因子病毒、弓形体病毒、或高热、毒血症、缺氧、休克等因素影响胎儿发育；分娩时胎位异常、产程过长、剧裂宫缩、脐带打结或绕颈、羊水吸入、产伤、窒息等损伤脑神经因子，这些均可诱发脑发育不良。
宝宝脑部发育不良的原因之环境因素
母亲自身的环境，可能对母体胎儿产生的影响，如母亲有糖尿病，胎儿受其内环境的影响而导致先天性心脏病或无脑儿的发病;母亲有甲状腺功能低下，胎儿容易产生骨和牙齿的畸形、隐睾、伸舌样痴呆、甲状腺肿大等，这也是脑发育不良的一大病因。
宝宝脑部发育不良的原因之营养因素
早期营养不良能使脑神经因子分裂期缩短，晚期营养不良能使每个脑神经因子的体积减小，如果早期特别是胎儿期营养不良，虽然出生后营养得到改善，智力恢复仍然较慢或难以恢复会导致脑发育不良。
