1、网上申报。上首先承包人登陆政府门户网站，然后在建设工程合同备案管理信息系统进行合同备案网上申报，根据合同的具体性质、内容在对应的合同备案表中填写相关信息，打印出带条型码的合同备案表。
2、办理备案手续。合同当事人携带相关资料到合同备案管理机构办理合同备案手续。
3、正式签发合同备案表。备案机构审核合同当事人提供的合同备案资料，符合要求的，加盖合同备案专用章。
发包方办理施工合同备案时应提交以下资料，并对相关内容的真实性、完整性和合法性负责：
1、完整的施工合同文本;
2、国有资金建设工程，需提供招标文件、中标通知书、中标人的投标文件，前述资料若已在备案机构办理过招标控制价和中标价备案的工程无需重复提交;非国有资金建设工程，提供项目发承包基本情况表、预算书或已标价工程量清单;
3、委托招标代理的建设工程,提交招标代理机构出具的合同条款符合性核对意见书;
4、法律、法规及相关规范性文件要求提交的其他资料。
1、施工合同格式文本应采用住房城乡建设部及国家工商总局联合制定的《建设工程施工合同(示范文本)》(除使用国外资金投资建设等特殊情况的工程项目外)。国有资金投资建设工程施工合同的专用条款部分还应执行《重庆市房屋建筑工程和市政基础设施工程施工合同专用条款(示范文本)》，合同专用条款的有关约定内容应符合建设行业行政主管部门所颁布的有关规定;
2、有关承包范围、工期、项目负责人等的约定与招标文件、中标人的投标文件、中标通知书表述一致;
3、有关工程质量的约定须符合工程建设强制性标准，与招标文件、中标人的投标文件、中标通知书中关于质量标准的要求表述一致;
最后，建筑施工合同的备案是为了完成国家的建设任务，因此国家要保证合同中的分工明确，责任清楚，这样才能高效地完成建筑施工工作，合同备案同时也是为了保护承包方，被承包的工程不能进行二次承包。
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