为鉴定和检测目的将标记物（如放射性同位素、荧光素或酶）共价连接到另一种化合物上，通过被标记化合物与待检测物之间的特异性反应形成多元复合物，经与未结合的标记物分离后，即可用较简易的方法鉴定和检测待检测物。

例如，放射性同位素标记技术广泛用于研究带标记的物质、在体内的代谢过程及其代谢产物。酶标记免疫技术是将抗原、抗体或半抗原与过氧化物酶共价结合成复合物，此复合物既保留免疫反应物的决定簇，即免疫反应的特异性，又不影响酶的催化活性，这样在免疫学反应后即可通过酶与底物反应生成的产物对被检测化合物进行鉴定和定量。

Marker：染色体上一个可以被识别的区域（比如限制性内切酶的酶切点，基因的位置等）。标记的遗传能够被检测出来。标记可以是染色体上有表达功能的部分（比如基因），也可以是没有编码蛋白质功能但遗传特性能够被检测出来的部分。