在空印案爆发之后，湖广按察使佥事郑士元也因为受到了牵连而入狱，但是没多久之后被释放了。同年因为发生了形变，于是朱元璋便下诏求言。此事郑士元的弟弟郑士利便对“空印案”爆发的原委以及新政所存在的一些问题进行了上述，进行了详细的描述，针对“空印案”，他提出了四个观点：
1、空印账册所盖的印为骑缝印，而且每张纸上的印记并不完整，像这样盖了印章的白纸即便是流出去了也很难作为凭据。况且这种加盖了印章的白纸也是很难被流出去的。所以基本上不会有什么官员会利用印纸进行弄虚作假，做出危害老百姓的事情。
2、钱粮账目的数字，府必合省，省必合部，若是出现了什么差错，那么最后就要由户部说了算。而省部距离较远的有六七千里，进的也有个三四千里。若是一旦出错了，那么往返就要差不多一年的时间。这种先印而后书确实为权宜之计。
3、国家在立法方面需要有明确的法律，从而就能使得朝廷来根据法律来惩处违法者。然而在朝廷的律法当中并没有针对空印的法律，大家长期以来也都是这么去做的，而且从未有人告知这么做是有罪的。如今这样严重的惩罚，难以服众。
4、培养一位合格的官员是非常困难的，耗时又耗力。而且那些能够做到省府级别的官员，更是需要数十年的时间去培养。如今牵连的范围如此之广，这对朝廷来说也是不小的损失。
郑士利原本想的是借这次机会能够劝说着朱元璋放弃株连，胆子自己想象的与实际差别还是巨大的。在看到郑士利的上书后，朱元璋再一次大怒，命令去追查其幕后的主使者。虽说最终啥也没查出来，但是郑士利还是遭到了流放。而且那些遭受牵连的官员不但没有获得赦免，就连郑士利的哥哥郑士元也因为这次上书再一次的被抓了起来，并且一并流放了。
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