生理性病害又称非侵染性病害，是由于生长条件不适宜或环境中有害物质的影响而造成的生长不良现象。这种病害虽无病原物，不会相互传染，但一旦发生则会造成重大损失。
菌丝淡化
（1）症状
菌丝生长稀少，菌棒软绵无弹性。
（2）病因
①灭菌前培养料已经发生霉变，杂菌释放的抗菌素浓度过高或杂菌的活动改变了培养料的ph值；
②培养料选用不合适，如选用未经脱脂处理的针叶树木屑而导致油脂及萜烯类物质浓度过高，抑制香菇菌丝生长；
③过量添加硫酸镁等化学物质；
④缺少某些必需的营养元素。
（3）ph试纸
选用新鲜优质的培养料，采用合理配方，不随意添加化学物质；拌料后及时严格灭菌，防止酵母菌发酵而改变培养料的ph值。
菌丝徒长
（1）症状
袋栽香菇筒表面，不断长出浓密白色绒毛状菌丝，有的长后倒伏，倒伏了又长，菌皮逐渐变厚，有的甚至不倒伏，转色不能进行，这就是菌丝徒长现象。
（2）病因
①香菇房的设置不妥，如窗户太少，室内光线太暗。
②培养料含水量高或空气湿度大。
③通气太少，换气太轻，特别是当菌丝开始浓白要加大通气量时却缺少通气。
④掀动薄膜太轻，或掀动薄膜时间太短，或配料中加入玉米粉之类的营养物太多等，碳氮比例失调。
（3）菌丝徒长的危害
①消耗浪费养分。
②菌皮层层加厚，使菌丝体正常的呼吸受到抑制，坚韧的菌皮还会妨碍子实体原基的形成和生长，不利香菇生长。
（4）防治
出菇期间，要创造一个有利于子实体生长的环境条件.当香菇的菌丝浓白，已达2厘米仍不倒伏，并出现参差不齐菌丝时，必须掀开薄膜通气一至数天，直至栽培块（袋）及四周不粘手时再盖上，第二天不必掀动，让料面水汽迫使菌丝倒伏而转色.仍不倒伏时，可再掀开薄膜，打开门和窗，待料面干燥后，用新排笔轻轻刷一下，惊扰表面菌丝，迫使倒伏转色，或者晾干后用5%石灰澄清水喷一遍，晾一晾，盖好薄膜，即可倒伏转，效果甚佳色。
