公元1606年 三月
（丙午 明万历三十四年 三月）
云南人杀税监杨荣 初，云南税使太监杨荣奏开宝井，又胁土司木增献地开采。番汉居民恨之入骨，烧税厂，杀官吏。杨荣恣行毒虐，杖毙数千人。至是，以求马不获，系指挥使贺瑞凤。于是云南指挥贺世勋等率寃民万余人烧杨荣住宅，杀杨荣及其党徒二百余人。事闻，神宗数日不进食，欲逮问土司。以阁臣沈鲤揭争，神宗只诛贺世勋等，余皆免逮，未敢大事株连。
新添(今贵州贵定)苗民自去年平播州后，攻掠邻土无虚日，至是，贵州巡抚郭子章讨平之。
公元1606年 四月
（丙午 明万历三十四年 四月）
朱旺口河工成，约百七十里，役夫五十万，费时六个月。
公元1606年 五月
（丙午 明万历三十四年 五月）
河套鞑靼复犯延绥，败走。
公元1606年 六月
（丙午 明万历三十四年 六月）
缅甸攻陷木邦(即孟邦土司，治今缅甸兴威，辖今缅甸掸(shàn善，邦东北地区)，自是，地入缅甸。
公元1606年 七月
（丙午 明万历三十四年 七月）
大学士沈一贯、沈鲤并致仕 沈一贯被交章劾“奸贪”求去。而沈一贯数与鲤忤，惧去后鲤为己忧，因密倾之。神宗亦嫌沈鲤方鲠，会鲤同时乞休，遂并致仕。
公元1606年 十一月
（丙午 明万历三十四年 十一月）
云南建水有约六级地震，震中烈度为八至九。
朵颜结鞑靼诸部台吉等以万骑迫山海关，总兵官姜显谟拒却之。
公元1606年 十二月
（丙午 明万历三十四年 十二月）
凤阳人刘天绪以在南京传法术谋起事，事觉被杀。
弃辽东六堡 以明边政腐败及辽东女真诸部之反抗侵扰，至是，李成梁以辽东宽甸(今鸭绿江以北、辽宁丹东以北)等辽东六堡，孤堡难守，与督抚蹇达、赵楫建议弃之。尽徙居民于内地，居民恋家室则以大军驱迫之，死者狼藉。给事中宋一韩力言“弃地非策”，御史熊廷弼亦以为言，神宗皆不纳。李成梁反以招复逃人功增秩受赏。自是辽左藩篱尽撤，辽沈失去资以防卫之前卫，给努尔哈赤军事发展、收聚部众、利用汉人以有利之机。
公元1606年 是岁
（丙午 明万历三十四年 是岁）
蒙古五部喀尔喀上汗号于努尔哈赤，尊称为神武皇帝。
