长期大量的使用农药其污染及危害是极为严重的，农药会对土壤、大气、水体产生严重的污染，土壤是人类赖以生存的物质基础，受农药使用历史、施用技术以及产品结构等因素的影响，土壤农药污染已经成为制约食品安全与农业可持续发展的主要问题。
农药对土壤的污染与施用农药的理化性质、农药在土壤环境中的行为及施药地区自然环境条件密切相关。农药的理化性质是农药对土壤污染的重要因素之一。建国初期至20世纪70年代我国使用的无机类、有机氯农药的性质极稳定，不易分解，尤其有机氯农药水溶性高、脂溶性低，表现高残留、易迁移的特性，致使此类农药禁用近20年后全国大部分地区土壤中仍有残留。如1992年国家环保总局测试表明，江苏南通棉区土壤中DDT最高残留量仍达1123 mg/ kg。
农药污染土壤的途径
1.施用于田间的各种农药大部分落入土壤中，附着于植物体上的部分农药因风吹雨淋落入土壤中;
2.使用浸种、拌种等施药方式，或是将农药直接撒于土壤中，造成污染的累积;
3.近年来采用喷射方法(如飞机喷射)使用农药，估计有50%以上的农药从叶面落入土壤，也有大量的农药撒在或蒸发到空气中，一旦降雨，随雨水降落到土壤中，污染土壤。
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