生态农业的优缺点主要体现在实施的过程中和实际情况的变动以及技术的不足等。
优点：
1.展生态农业能够保护和改善生态环境，防治污染，维护生态平衡，提高农产品的安全性，变农业经济的常规发展为持续发展，把环境建设同经济发展紧密结合起来，在最大限度地满足人们对农产品日益增长的需求的同时，提高生态系统的稳定性和持续性，增强农业发展后劲。
2.生态农业强调发挥农业生态系统的整体功能，以大农业为出发点，按“整体、协调、循环、再生”的原则，全面规划，调整和优化农业结构，使农、林、牧、副、渔各业综合发展，并使各业之间互相支持，相得益彰，提高综合生产能力。
3.生态农业通过物质循环和能量多层次综合利用和系列化深加工，实现经济增值，实行废弃物资源化利用，降低农业成本，提高效益，提高就业机会，保护农民从事农业的积极性。
缺点：
1.技术体系不够完善，在生态农业实践中，还缺乏技术措施的深入研究。生态农业是一种复杂的系统工程，它需要包括农学、林学、畜牧学、水产养殖、生态学、资源科学、环境科学、加工技术以及社会科学在内的多种学科的支持。
2.农业的产业化水平不高，发展生态农业的根本目的是实现生态效益、经济效益和社会效益的统一。
3.生态农业分布不均匀，主要集中于大洋洲、欧洲、美洲等发达的国家，仍然没有在全世界范围内得到推广。
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