侵权商标的起算时间是从法院立案后开始计算的，当事人可以根据实际的诉讼请求，来提出起诉并要求赔偿。根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，人民法院适用普通程序审理一审民事案件的审限为6个月，有特殊情况需要延长的，由本院院长批准，可以延长6个月;还需要延长的，报请上级法院批准; 适用简易程序审理案件的审限为3个月，不能延长，若3个月内不能审结，转为普通程序继续审理。
《中华人民共和国商标法》第六十三条规定：侵犯商标专用权的赔偿数额，按照权利人因被侵权所受到的实际损失确定;实际损失难以确定的，可以按照侵权人因侵权所获得的利益确定;权利人的损失或者侵权人获得的利益难以确定的，参照该商标许可使用费的倍数合理确定。对恶意侵犯商标专用权，情节严重的，可以在按照上述方法确定数额的一倍以上三倍以下确定赔偿数额。赔偿数额应当包括权利人为制止侵权行为所支付的合理开支。
对于侵犯注册商标专用权的，依据《中华人民共和国商标法》第五十三条、《商标法实施细则》第四十三条规定，工商行政管理机关可以采取下列措施给以处罚。
(1)责令停止侵权
具体措施如下：
①责令立即停止销售;
②没收、销毁侵权商品;
(2)处以罚款
对侵犯注册商标专用权但尚未构成犯罪的，工商行政管理机关可以根据情节处以非法经营额50%以下或侵权所获利润五倍以下的罚款;对侵权单位的直接责任人员，可根据情节处以1万元以下罚款。
对以上两项处理不服的，当事人可以收到通知之日起15天内依照《中华人民共和国行政诉讼法》向人民法院起诉。逾期不起诉又不履行的，由工商管理机关申请人民法院强制执行。
(3)就侵犯商标专用权的赔偿数额进行调解
进行处理的工商行政管理部门根据当事人的请求，可就侵犯商标专用权的赔偿数额进行调解，调解不成的，当事人可依法向人民法院起诉。
在司法实践中，法院审理任何民事纠纷的审理时间都是从立案开始计算的，对于商标侵权的行为，应当自发生侵权事实的那时就已经存在的，相关情况可以基于实际来进行认定，具体情况由法院对商标侵权的事项进行调查后认定。
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