由当事人协商解决;协商不成的，由人民政府处理。单位之间的争议，由县级以上人民政府处理;个人之间、个人与单位之间的争议，由乡级人民政府或者县级以上人民政府处理。土地使用权在国内是非常重要的，就算有土地使用权也是可能遇到一些纠纷问题的。
《中华人民共和国土地管理法》第十六条(以下简称“十六条”)规定：“土地所有权和使用权争议，由当事人协商解决;协商不成的，由人民政府处理。单位之间的争议，由县级以上人民政府处理;个人之间、个人与单位之间的争议，由乡级人民政府或者县级以上人民政府处理。当事人对有关人民政府的处理决定不服的，可以自接到处理决定通知之日起三十日内，向人民法院起诉。
土地使用证是确认土地使用权的法律凭证。根据《中华人民共和国土地管理法实施条例》，国家依法实行土地登记发证制度。依法登记的土地所有权和土地使用权受法律保护，任何单位和个人不得侵犯。土地登记内容和土地权属证书式样由国务院土地行政主管部门统一规定。
土地使用证内各项数据和编号，如单位名称、四至、土地数量、位置、土地变更等，必须与土地登记表相一致。土地使用证附图可根据土地利用现状底图或地籍图透绘获得。随着面积和界线的变更，附图也应作相应改动。
根据《中华人民共和国土地管理法实施条例》第六条，依法改变土地所有权、使用权的，因依法转让地上建筑物、构筑物等附着物导致土地使用权转移的，必须向土地所在地的县级以上人民政府土地行政主管部门提出土地变更登记申请，由原土地登记机关依法进行土地所有权、使用权变更登记。土地所有权、使用权的变更，自变更登记之日起生效。依法改变土地用途的，必须持批准文件，向土地所在地的县级以上人民政府土地行政主管部门提出土地变更登记申请，由原土地登记机关依法进行变更登记。
根据《中华人民共和国城市房地产管理法》房地产转让或者变更时，应当向县级以上地方人民政府房产管理部门申请房产变更登记，并凭变更后的房屋所有权证书向同级人民政府土地管理部门申请土地使用权变更登记，经同级人民政府土地管理部门核实，由同级人民政府更换或者更改土地使用权证书。
目前我们国家对于土地使用这方面有非常明确的规定。比如说有土地使用证的情况之下的话，那么是需要由双方当事人协商来进行确定，如果能够协商一致的话就可以及私底下解决，协商不成的情况之下，关于土地使用权问题，有权属纠纷可以诉讼解决。
延伸阅读：
商业用地土地使用权到期后怎么办...
土地使用权转让时交纳的税费有哪...
土地使用权转让的税费，包括营业税，教育附...
农村土地使用权年限能永久转让吗...
农村土地使用权年限，显然是不能永远转让的...
土地使用权转让限制条件有哪些？
国有土地使用权抵押登记怎么办理...
办事流程：1、 受理申请。2、 组织报批...
土地使用权证遗失
