宅基地是集体所有的土地，村集体为保障其成员居有其屋，向本集体的农户分配宅基地使用权。宅基地使用权是由《民法典》所明确规定的一项用益物权，而房屋是村民个人所有的财产。
若宅基地因为纠纷不能确权，应当先解决好纠纷问题。宅基地纠纷的解决办法，主要有三种：
1、协商解决
土地所有权和使用权争议，由当事人协商解决。据此规定，公民之间发生的宅基地纠纷，应当先通过协商的方式加以解决。
2、行政解决
个人之间，个人与单位之间争议，由乡级人民政府或者县级以上人民政府处理。侵犯土地的所有权或者使用权争议，由县级以上地方人民政府土地管理部门责令停止侵犯、赔偿损失。
3、司法解决
当事人对有关人民政府的处理决定不服的，可以在接到处理决定通知之日起30日内，向人民法院起诉。‘这表明公民之间就土地的使用权和所有权发生的纠纷，只与按照《土地管理法》第16条和第53条的规定，先经过有关行政机关的处理，对于处理决定不服，才可以向人民法院提起诉讼。否则，人民法院不予受理。但对于侵犯土地的所有权或者使用权的，被侵权人可以不经行政机关的处理，而直接向人民法院起诉。
此外，宅基地纠纷还可以通过人民调解来解决。人民调解是指在调解委员会(包括城市的居民委员会和农村的村民委员会)的主持下，以国家的法律、法规规章、政策和社会公德为依据，对民间纠纷当事人进行说服教育、规劝疏导，促进纠纷当事人互相谅解，平等协商，从而自愿达成协议，消除纷争的一种群众自治活动。
2、未经土地管理部门审批或者采取欺骗手段骗取建房手续用地建房，侵犯了集体或相邻关系人利益引发的纠纷;
5、用地建房影响相邻关系人利益引发的纠纷;
6、未经共同使用人同意，部分共用人擅自使用共用的宅基地而引发的纠纷;
7、未经有关部门确权和统一规划的宅基地因界址不明引起的纠纷。
三、宅基地因自然灾害灭失了怎么办？
宅基地因自然灾害等原因灭失的，宅基地使用权消灭。对失去宅基地的村民，应当依法重新分配宅基地。
因自然灾害导致宅基地灭失的，应当重新分配宅基地。这里的宅基地灭失就是指宅基地无法再用于居住的情况。自然灾害等原因可能使土地不再适用用途，例如山体滑坡，原来住宅所在的土地不能再建房居住。在发生这类自然灾害，原有宅基地不可能再用于建设住宅的情况下，就必须对丧失居住条件的集体成员提供新的宅基地以维持生计。
可以享受重新分配宅基地的权利人应当是成员。宅基地使用权是基于集体成员身份享有的一种保障性的权利。所以重新分配宅基地时，应当按照规定的标准分配给属于本集体且丧失基本居住条件的村民。在重新分配宅基地应当按照国家有关规定，注意节约利用和保护耕地。
有关农村宅基地确权证的办理必须由宅基地的使得者根据相关法律规定的要求来进行办理，需要注意的是，土地确权证的办理必须按照当地的实际情况来进行办理，地方政府的土地管理部门应当制订符合当地土地管理情况的办法来进行处理。
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