税收行政诉讼的基本程序有五个步骤，人民法院审理税务行政诉讼案件的法定程序。我国税务行政诉讼实行“两审终审制”，当事人提起诉讼后，先由一审法院进行审理。
(1)宣布开庭。审判长查明当事人是否到庭，宣布案由，合议庭组成人员、诉讼参加人名单，告之当事人权利;
(2)法庭调查。包括询问当事人、证人、鉴定人;出示证据并判定其真实性、合法性、证明力;宣读勘验笔录和现场笔录;当事人各方向法庭提供支持自己诉讼主张的法律依据。
(3)法庭辩论。由当事人各方陈述自己的理由和根据，批驳对方观点和论据。首先由原告及其代理人发言，然后由作为被告的税务机关及其代理人发言，最后由双方展开辩论。
(4)合议庭评议。由三名以上的审判员或陪审员组成合议庭作为独立审判机构，通过民主讨论来认定事卖，确定适用法律，决定合议庭对案件的处理意见。
(5)宣告判决。对一审判决或裁定，当事人可以上诉，以及时解决行政纠纷，提高办案效率，充分保护当事人合法权益，加强法律监督。二审的具体程序与一审程序基本相同。
行政诉讼与行政复议两个法律制度的衔接，是由以下两项法律原则所决定的：一是司法最终解决原则，即行政复议并非终局裁决，行政相对人对行政复议决定不服的，仍然可以提起行政诉讼。由司法机关决定对所争议的行政行为作出最终裁决。二是行政复议并非必经阶段原则，行政复议的存在主要是考虑效率，而行政诉讼则更具有公正性的裁决。
根据规定，公民、法人或者其他组织申请行政复议，行政复议机关已经依法受理的，或者法律、法规规定应当先向行政复议机关申请复议、对行政复议决定不服再向人民法院提起行政诉讼的，在法定行政复议期限内不得向人民法院提起行政诉讼。
开庭的时候，案件的原告和被告都必须出庭，代理律师也要出庭，如果不是不能公开的案件，案件以外的人都可以去旁听。开庭到了中间环节，原告和被告都有最后阐述自己观点的机，法官会根据收集的证据进行反驳或支持。
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