1、容器：蜂巢蜜最好用陶瓷容器或玻璃容器保存，原因是蜂巢蜜中富含有机酸等酸性物质，若长期用铜、铁等金属容器保存易发生化学反应而提前变质，另外蜂巢蜜一般也不建议用塑料容器长期保存。
2、密封：蜂巢蜜在保存过程中一定要严格密封好，原因是蜂巢蜜有较强的润泽性且易吸收空气中的水分，若密封不严易因混入水分而引起微生物大量繁殖，另外密封不严的蜂巢蜜还易发生串味的情况。
3、取用：蜂巢蜜一定要用卫生且干燥的勺子取用，原因是用不卫生的勺子取用极易污染蜂巢蜜，若用潮湿的勺子取用则易使蜂巢蜜因混入水分而变质，另外蜂巢蜜每次取用后都一定要及时重新密封好。
