植物可以修复被硒污染的土壤，许多植物可以从污染土壤中吸收硒并将其转化成可挥发状态的二甲基硒和二甲基二硒，其毒性比无机硒低99.5%～99.7%，从而降低了硒对土壤生态系统的毒性。
不同类植物累积硒的能力是不同的。向日葵能吸收多于400mg/kg的硒，小麦可以累积多于80mg/kg的硒。十字花科植物，例如花椰菜和芥菜类能比其他作物累积更多的硒。在种植印度芥菜的第一年和第二年可使土壤中的全硒减少48%和13%。可见，印度芥菜具有较高的吸收和累积硒的能力。一些农作物如水稻、花椰菜、卷心菜、胡萝卜、大麦和苜蓿等及一些水生植物也有较强的吸收并挥发土壤硒的能力。蔬菜的食用部分含硒量低于非食用部分。食用部分含硒量超过100mg/kg的蔬菜有：花椰菜、洋葱、豆类、菠菜。尽管各种作物累积硒的能力有差别，但生长在含中量水溶性硒的土壤上的所有植物都能累积硒。
此外，含硒的废水也可利用植物来进行净化。在美国加州的一个人工构建的二级湿地功能区中，种植的不同湿地植物品种显著地降低了该区农田灌溉水中的硒含量，在一些场地，硒含量从25mg/kg降低到5mg/kg以下，这证明含硒的工业和农业废水可以通过植物修复进行无害化处理
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