只要构成犯罪就会留有案底，跟犯罪嫌疑人是否认罪认罚没有任何关系，因此，认罪认罚不起诉也是会有案底的。
法律依据：
《刑事诉讼法》第十五条，犯罪嫌疑人、被告人自愿如实供述自己的罪行，承认指控的犯罪事实，愿意接受处罚的，可以依法从宽处理。
第一百七十二条，人民检察院对于监察机关、公安机关移送起诉的案件，应当在一个月以内作出决定，重大、复杂的案件，可以延长十五日;犯罪嫌疑人认罪认罚，符合速裁程序适用条件的，应当在十日以内作出决定，对可能判处的有期徒刑超过一年的，可以延长至十五日。人民检察院审查起诉的案件，改变管辖的，从改变后的人民检察院收到案件之日起计算审查起诉期限。
目前我国刑法并未规定认罪认罚可以减轻百分之多少，具体从轻、减轻处罚多少，要视犯罪嫌疑人的犯罪性质、犯罪情节、犯罪后果的严重程度等方面酌情决定，若罪行较轻，犯罪后果较轻的，减轻处罚的幅度会较大一些。如果犯罪嫌疑人自愿如实供述自己的罪行，对指控的犯罪事实无异议，同意量刑建议，签署具结书的，可以依法从宽处理。对于表现好，积极服从管理，好好改造的犯罪分子，由执行机关向中级以上人民法院提出减刑建议书。人民法院应当组成合议庭进行审理，对确有悔改或者立功事实的，裁定予以减刑。非经法定程序不得减刑。
根据《刑法》 第七十八条被判处管制、拘役、有期徒刑、无期徒刑的犯罪分子，在执行期间，如果认真遵守监规，接受教育改造，确有悔改表现的，或者有立功表现的，可以减刑;有下列重大立功表现之一的，应当减刑：
减刑以后实际执行的刑期不能少于下列期限：
(一)判处管制、拘役、有期徒刑的，不能少于原判刑期的二分之一;
(二)判处无期徒刑的，不能少于十三年;
(三)人民法院依照刑法第五十条第二款规定限制减刑的死刑缓期执行的犯罪分子，缓期执行期满后依法减为无期徒刑的，不能少于二十五年，缓期执行期满后依法减为二十五年有期徒刑的，不能少于二十年。
触犯了法律应该主动的到公安机关投案自首，并积极配合公安的调查的工作，对于有悔罪认罪认罚的当事人，司法机关会考虑从宽处理，在服刑期间表现良好的可以获得减刑的机会。
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