施工合同未备案有的后果是可能会导致双方之间发生太多的争议。施工合同没有备案的，没有多大的后果，因为目前《建筑法》删除了强制备案的条款，现在施工合同不用强制备案了，当事人备不备案，没有太大的关系，施工合同不会因合同没有备案而无效的。
根据《民法典》第五百零二条规定：“依法成立的合同，自成立时生效，但是法律另有规定或者当事人另有约定的除外。依照法律、行政法规的规定，合同应当办理批准等手续的，依照其规定。未办理批准等手续影响合同生效的，不影响合同中履行报批等义务条款以及相关条款的效力。应当办理申请批准等手续的当事人未履行义务的，对方可以请求其承担违反该义务的责任。
依照法律、行政法规的规定，合同的变更、转让、解除等情形应当办理批准等手续的，适用前款规定。”合同自成立时，就发生法律效力，法律另有规定的，按照其规定，以前《建筑法》有规定发包单位应当在建设工程合同签订的30日内，送工程所在地建设行政主管部门备案，但经过修改后，把这个条款删除了，这样就不用强制备案了，施工合同只要是合法成立，就应当产生法律效力，不会因未备案而无效的，毕竟现在合同不用强制备案了。
二、施工合同的监督方式是什么?
《民法典》第七百九十六条规定：“建设工程实行监理的，发包人应当与监理人采用书面形式订立委托监理合同。发包人与监理人的权利和义务以及法律责任，应当依照本编委托合同以及其他有关法律、行政法规的规定。”发包人应当和监理人订立委托监理合同，监督施工合同的实施，承包人未按照施工合同来进行建造的，监理人可以通知给发包人，然后发包人可以追究承包人的违约责任。
在现实生活当中，建筑工程施工合同是规定在我们国家《民法典》当中的同时要求建设工程如果实行的是监理，发包人应当与监理人采取书面合同订立相关的合同，并且最好建筑工程施工活动还是要备案。
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