(一)有无奸淫的目的不同。前行为的目的在于奸淫不满14周岁的幼女，即与之发生性关系;后行为则无此目的，其是为了通过猥亵儿童来满足、兴奋自己的畸形、变态的性欲。
(二)行为的方式不同。前行为的方式为奸淫的行为，只能发生在异性之间;后行为幼女即与幼女发生性关系的方式则为除性关系以外的所有淫秽、下流行为、既可以发生在异性之间，也可以发生在同性之间。
(三)行为的主体不同。前行为的主体必为男子，后行为的主体既可以为男子也可以是女人;前行为的主体年满14周岁即可构成犯罪，后行为的主体则要求年满16周岁才能构成其罪。
(四)所侵害的对象不同。前行为所侵害的对象为未满14周岁的幼女;后行为所侵害的对象则为未满14周岁的儿童，既可以是女性儿童即幼女，又可以是男性儿童。行为人在奸淫幼女的前后，实施了抠摸幼女下身、要幼女为之玩弄、吸吮生殖等猥亵行为的，属吸收犯，后行为被前行为所吸收，应以吸收行为即前行为构成的强奸罪依法追究行为人的刑事责任。
二、猥亵儿童罪的责任承担
《刑法》第二百三十七条规定，猥亵妇女的处以5年以下有期徒刑或者拘役;聚众或者在公共场所当众犯前款罪的，处5年以上有期徒刑;猥亵儿童的，依照两款的规定从重处罚。依照上述规定，也就是说，行为人只有在“聚众或者在公众场所当众”猥亵儿童时才将处以5年以上有期徒刑。以上两个法定加重处罚情节过于狭隘，远不足以惩罚猥亵类犯罪分子。 如果仔细看一下《刑法》中对于强奸罪的量刑，就知道对于猥亵儿童罪的量刑规定不仅完善了《刑法》第二百三十六条规定，犯强奸妇女罪的，处3年以上10年以下有期徒刑;情节特别严重的或者致人重伤、死亡的，处10年以上有期徒刑、无期徒刑或者死刑。根据司法解释，强奸妇女罪中的情节特别严重，一般是指：强奸妇女手段残酷的;强奸妇女多人或多次的;轮奸妇女的首要分子;因强奸妇女引起被害人自杀、精神失常以及其他严重后果的;在公共场所劫持并强奸妇女，在社会上造成很坏影响、极大危害的，等等。多次猥亵未满16周岁的儿童或者猥亵多人，造成的身心伤害，绝不亚于奸淫幼女，后者的课刑要远重于前者;而因猥亵造成被害人精神失常、自杀等严重后果的，更应予以严惩。故建议参照强奸罪的法定加重处罚情节，将上述司法解释的规定作适当修改后纳入猥亵儿童罪的第二款中，并曾设“对行为造成特别严重后果或者犯罪情节特别恶劣的，可以判处无期徒刑”的规定，以合乎刑法之“罪、责、刑相适应”原则。
综合上面所说的，猥亵儿童罪与强奸幼女罪两者的区别是特别大的，执法人员在处理的时候就会根据两者的条款来进行实施，但共同点都是以不合法的方式来伤害未成年人，从而导致未成年人的心理受到很大的伤害，所以，不同的方式所处理的方法就会不一样。
