环境行政处罚案由有作为类型的案件，不作为类型的案件。行政案件的案由分为：作为类案件、不作为类案件、行政赔偿类案件
在立案审查阶段，可以根据当事人的起诉确定初步案由。在审理阶段，如果发现初步确定的案由不准确时，应当根据审理后确定的法律关系性质来确定结案案由。因此，本规定既适用于审查起诉阶段，也适用于审理阶段，但法律文书和卷宗封面等均应以结案案由为准。
二、环境处罚和处分的不同是什么?
环境行政处分和环境行政处罚虽然都是环境行政主体所作的制裁行为，但两者从根本上说是不同的行政制裁方式，其区别主要表现为：
1、制裁的对象不同。环境行政处罚制裁的对象是违反环境行政法律规范的公民、法人或其他组织;环境行政处分的对象仅限于环境行政主体系统内部的公务员。
2、采取的形式不同。环境行政处罚的形式有：警告、罚款、责令停产停业、责令重新安装或使用、责令支付消除污染费用、责令赔偿国家损失等;行政处分的种类有警告、记过、记大过、降级、撤职和开除六种形式。
3、行为的性质不同。环境行政处罚属于外部行政行为，以行政管辖关系为基础;环境行政处分属于内部行政行为，以行政隶属关系为前提。
4、所依据的法律、法规不同。环境行政处罚依据的是有关污染防治和自然资源保护方面的法律、法规，如《环境保护法》，《大气污染防治法》，《矿产资源法》等;环境行政处分则由有关行政机关工作人员或公务员的法律规范调整，如《国家公务员暂行条例》、《行政监察条例》等。
5、济途径不同。对环境行政处罚不服的，除法律、法规另有规定外，环境行政相对人可申请复议或提起行政诉讼;对于环境行政处分不服的，被处分的公务员只能向作出处分决定的机关的上一级机关或监察部门申诉。
近几年国家对于环境的重视程度不断加深，除此以外有关的行政处罚的力度也在不断加大，所以对于问题的解决有关的当事人要积极的了解有关的规定，否则对于自己的利益维护就会造成一定的不良影响，但是最为关键的还是权益会受到损失。
在当代的社会，行政处罚决定是由行政机关所作出的，如果存在环境类型的污染行为，肯定是需要进行一定的行政处罚。但需要提醒大家注意解的是，其实是环境破坏类型的行政案件，案由也是有所不同的。
